اطلاعات ثبت شده به صورت نسخه الکترونیک برای وزارت بهداشت ارسال می‌گردد. پزشکیار باستانی طب با اخذ مجوز از آزمایشگاه وزارت بهداشت، تاییده ارسال نسخ الکترونیک به وزارت بهداشت را دریافت نموده است.

مقوله انکارناپذیری در پزشکیار باستانی طب پیاده‌سازی شده است. برای ثبت‌نام، شماره نظام‌پزشکی و شماره‌ملی فرد ثبت‌نام کننده با پایگاه داده نظام‌پزشکی مطابقت داده شده و درصورت صحت اطلاعات ثبت‌نام آن فرد به‌صورت خودکار تایید خواهد شد. به این شکل می‌توان از هویت واقعی و مجوزهای لازم برای طبابت درمانگران اطمینان حاصل نمود.

در سامانه، امکان استعلام استحقاق درمان برای بیماران در نظر گرفته شده است. نسخه الکترونیک ثبت شده برای بیمارانی که استحقاق درمان دارند برای صندوق‌های تحت پوشش بیمه سلامت یا کمیته‌ امداد امام‌خمینی ارسال می‌شود. این قابلیت‌ها از ابتدای مردادماه سال ۱۳۹۸ در حال اجرا بوده و پایه محاسبه پرداخت درمانگران طرف قرارداد می‌باشد.